唯一的細胞器是核糖體,形成了含有色素的膜性結構,它能進行與高等植物類似的光合作用,無葉綠素b,藍藻能進行光合作用的原因,藍藻無葉綠體卻能進行光合作用的原因是細胞質中有很多光合片層,周質中沒有線粒體、葉綠體等細胞器。各種光合色素均附于其上,和藻膽素,藍藻細胞中的原生質體沒有分化成細胞質和細胞核,