它在人類醫學中被用于個體鑒別、確定親緣關系、醫學診斷及尋找與疾病連鎖的遺傳標記;在動物進化學中可用于探明動物種群的起源及進化過程;在物種分類中,生物學方面:DNA指紋技術能夠從DNA分子水平給每個玉米品種一個"身份證號碼",也有區分同一物種不同品系的潛力,