灘涂養殖存在的問題有:灘涂養殖結構與布局不夠合理;灘涂養殖的 苗種質量有待提高;灘涂養殖的病害問題得不到有效控制;灘涂養殖水產品加工技術比較落后;灘涂養殖業的污染問題等。